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这个数据库可以分析基因家族,cBioPortal

2020/11/4 13:55:44 文章标签:

cBioPortal数据库是探索肿瘤的基因组学特征,是从DNA水平进行的,是对机制的进一步研究。基因差异表达、生存分析和免疫浸润分析,上述分析严格意义上讲均属于表型。免疫浸润分析属于交叉,算是表型式的解释,就是用现象解释…

cBioPortal数据库是探索肿瘤的基因组学特征,是从DNA水平进行的,是对机制的进一步研究。基因差异表达、生存分析和免疫浸润分析,上述分析严格意义上讲均属于表型。免疫浸润分析属于交叉,算是表型式的解释,就是用现象解释现象,但其实并没有涉及具体的机制。

 

TCGA数据中除包括样本的表达信息、生存分析信息,也包括突变、拷贝数、甲基化以及临床信息等数据,因此可用于多组学的交叉分析。今天,我们分享TCGA多组学分析的神器,肿瘤基因组学分析的神器——cBioPortal,不需要注册,登录即可免费使用:

 

cBioPortal(见文末)

 

下载.jpeg

cBioPortal网站目前存储DNA拷贝数数据(每个基因的假定,离散值,例如“深度缺失”或“扩增”,以及log2水平),mRNA和microRNA表达数据,非同义突变,蛋白质水平和磷蛋白水平(RPPA)数据,DNA甲基化数据和有限的临床数据等,可以快速获取大规模癌症基因组学项目的分子谱和临床预后相关性,并将这些丰富的数据集转化为可视化数据以用于临床。

 

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本文链接: http://www.dtmao.cc/news_show_350036.shtml

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